Anna-Sophie Fiston-Lavier... ma page perso

Après un DEUG (L1-L2) de biologie mention sciences de la vie, j'ai eu le plaisir de faire partie de la premiere promo de la Licence-Maitrise (L3-M1) de Bionformatique de Paris 7 cree par Serge Hazout. Attiree par la Genomique et le monde de la recherche, j'ai poursuivit ma formation avec un DEA de Genetique (M2) à Paris 6. Depuis octobre 2004, je suis en these de Bioinformatique dans l'equipe de Bioinformatique et Genomique dirigee par Hadi Quesneville.

Mon projet de recherche porte sur l’etude de la dynamique et impact evolutive des répétitions des genomes eucaryotes (duplications segmentaires, elements transposables et satellites). La première partie de ma these a consiste a annoter de manière automatique via un pipeline informatique, les duplications segmentaires chez Drosophila melanogaster (plus communement appelee "la mouche du vinaigre"). L'analyse de ces repetitions, nous a permis de proposer un modele de formation des duplications segmentaires chez les drosophillidees, modele inspire des modeles de reparations homologues des cassures double brin d'ADN. D'apres le modele propose, les elements transposables representent des acteurs important dans l'initiation de la formation des duplications.  En plus, de leur impact sur l'organisation des genomes, les elements transposables semblent etre impliques dans l'heterochromatinisation de l'ADN. Le statut particulier de l'heterochromatine leur confere ainsi un role evolutif majeur.
La seconde partie de mon travail a donc portee sur l'étude de dynamique évolutive des éléments transposables. L'analyse menee chez Arabidopsis thaliana  (apellee aussi l' "arabette des dames"), organisme modele riche en domaines heterochromatique (presence de knobs = domaines heterochormatique ne correspondant ni aux domaines centromerique et ni au centre organisateur nucleaire).